一、 学会理事会：由学会理事长、秘书长（副秘书长）、各分会理事长(副理事长)、理事组成，是学会最高权利机构。

二、 学会秘书处：由秘书长（副秘书长）、秘书、财务人员组成，是学会日常办公机构并协助各分会开展各项活动。

三、 学会监事会：由学会理事会推选产生，对学会章程、学会活动及学会财务等进行监督。

四、 波谱专业委员会（北京市波谱学会）由各专业分会推选各分会理事长（副理事长）、常务理事、理事。

五、 电镜专业委员会（北京市电镜学会）由各专业分会推选各分会理事长（副理事长）、常务理事、理事。

六、 光谱专业委员会（北京市光谱学会）由各专业分会推选各分会理事长（副理事长）、常务理事、理事。

七、 色谱专业委员会（北京市色谱学会）由各专业分会推选各分会理事长（副理事长）、常务理事、理事。

八、 质谱专业委员会（北京市质谱学会）由各专业分会推选各分会理事长（副理事长）、常务理事、理事。

九、 北京仪器商会